军统局的主要战斗目标是日寇。戴笠在军统局本部的一次大会上说，日本侵华部队不过几十万人，穿军装目标显著，我们用便衣来对付，花一定的价钱就可以杀个日本兵，花若干万元就可杀他个一二十万是办得到的，比在战场上更容易办到，坚持下去，日本就会在中国站不住脚。
他这个自以为高明的策略确实在沦陷区实践过，也确实行之有效，可是事情并不像他所想的那么简单，因为杀掉一个日本兵以后，便衣杀手虽然可以安全转移，可是当地的人民就会遭到日军的残酷报复，老百姓的生命财产损失很大，遂引起沦陷区人民的反感，蒋介石也不同意，他说花几个钱、杀几个人算不得本事，后来这个办法就停止了。
此时，军统的另一大目标是惩处汉奸，如对已经落水的上海伪市长傅筱庵以及未下水的唐绍仪。
傅筱庵于1938年10月16日出任伪上海市长后，不时有人把夹有子弹的警告信寄给他。在许多公开场合，傅筱庵亦成了行刺的目标。到1940年8月，他已先后遭刺三次，都侥幸免难，傅筱庵惶惶不可终日。
1940年3月，汪精卫伪国民政府成立后，蒋介石责令戴笠干掉汪精卫。戴笠派军统局书记长吴赓恕至沪，策划刺汪行动。吴找到与傅筱庵素有深交的开滦煤矿公司上海办事处经理许天民，希望拉拢傅筱庵一起刺杀汪精卫。傅与许交谈后，几经权衡，将刺汪计划向汪伪特工部全盘托出。许天民等先后入狱，吴赓恕隐匿租界，刺汪行动遭挫。戴笠将此事报告蒋介石，蒋即下令除掉傅筱庵，刺傅任务由陈恭澍组织执行。由于傅已戒备森严，几次狙击行动均未奏效，陈即决定从内线打开缺口。于是，便派杜茂在虹口斯高塔路傅宅附近开一家酒店，伺机利用傅家人作内应。
傅家有一仆人叫朱开，三十年来随傅筱庵走南闯北，一直被傅视为亲信。朱开生性嗜酒，不久便成为杜茂酒店的常客。朱、杜两人豪饮畅谈，引为知己，杜趁机进言，要他干掉傅筱庵。朱开素对日本人反感，对傅筱庵出卖许天民等人亦心怀不平，遂同意杀傅。10月11日，傅筱庵忙于参加各种应酬活动，深夜才归，照例在净房睡下。朱开入得房内，用一把锋利的菜刀朝正在熟睡的傅筱庵连砍数刀，傅当场气绝身亡。朱开从容出得傅宅，在杜茂的接应下，隐逸而去。事后，军统局受到了重赏。
