事实上，蒋介石此时的世界观依然十分左倾。我们可以从他和儿子在中山舰事件爆发前的信函往来中，看到这个左倾观点。2月12日，经国向父亲问起，日前来函似乎反映出“不脱离宗法社会的语意”，他请父亲说明孙中山先生的民主主义和共产主义之间的关系，究竟如何。蒋介石答说，前一封信里的旧式思想，意在测试经国，他很欣慰儿子本身的“思想、语言”，都很“正确”。他进一步解释说，孙中山的民生主义就涵盖了共产主义。他说，中国革命“只有在成为世界革命的一部分”之时，才有意义。
蒋介石3月16日发出的信函中，有支持儿子加入中国共产主义青年团的决定，并表示国民党和共产党原是“革命同志”。蒋介石晓得苏联秘密警察一定会拦截、阅读他给经国的信函；恐怕也刻意要在信中如此表态。但是，它也充分反映出蒋介石在针对中山舰事件采取行动之的前四天，仍然持有激进立场。
尽管爆发了中山舰事件，共产国际同意继续与国民党结盟合作。中共领导人虽然希望与国民党分手，但是却仍再度服从共产国际的决定，继续维持国共合作。斯大林最关心的是，如何牺牲中国东北权益，讨好日本人（托洛斯基此时的态度与斯大林无异)。苏共政治局接受“今后南满仍由日本掌控”，也同意苏联应与控制东北及华北部分地区的张作霖，维持“和平、稳定的关系”。斯大林明白表示，此一阶段的国共联合阵线应该极力排斥以积极军事行动统一中国的主张，也要回避可能把“帝国主义者推向军事干预之路”的一切行动。
1926年夏天，蒋介石出任国民革命军总司令，吴稚晖代表中央授旗。陈果夫出任国民党中央组织部部长这一要职。陈果夫在弟弟及他人的密切配合下，开始改组广东及邻近省份的国民党党部，革掉多数中共党员的领导职位及一些基层职位。陈果夫开始把他们的秘密“政治组织”渗透进入工会、农民协会及中国共产党之内。7月，蒋介石说服广州总商会，以大笔金额捐助国民革命军。蒋掌握住丰厚财源之后，开始了北伐行动，要把全中国统一在国民党旗下。蒋氏面临十倍于国民革命军兵力的各路军阀部队。
蒋经国仍以正面的角度看待中国的局势发展。他了解，他的父亲必须坚实掌握力量，对付广州的异议人士。中共党员认为中国的革命，以及中国国民党，终究要由他们的先锋党接管；蒋经国和他们看法不同，他相信，国民党在他父亲领导下，不仅将会击败帝国主义、统一中国，也将完成无产阶级的马克思主义革命。中国共产党在这个大局势之下，将是配角，最终将由国民党这个真正的先锋党，把它吸收、整合。
蒋经国在中山大学的中文期刊上发表一篇题为《中国国民革命与中国共产党》的文章，抨击中共阻碍革命事业，在国民党内部散播纷争的种子，集结游手好闲、流浪汉起来反抗国民党部队。他指控中国共产党进行渗透活动，扩大控制地区，并建立自己的武力。蒋经国认为，中共给中国真正的革命力量——他父亲领导的国民党，带来麻烦。4他与中国共产党的关系自此开始恶化，也是可想而知的。
10月，斯大林把托洛斯基逐出苏共政治局，谴责托洛斯基及其追随者是社会民主党偏离分子。可是，中山大学绝大多数中国学生、拉狄克以及若干老师，依然赞同托洛斯基的“不断革命论”观点，同学们开始称蒋经国是托派的组织者。接着，消息传来，蒋介石不顾苏联反对，率领人数微寡的国民革命军，跨出广东，展开北伐。蒋介石正是拉狄克经常鼓吹的革命党人大无畏的表率。
蒋经国身材并不高大，在同学里也称不上英俊貌美，但是他具备农家子弟雄犷的面貌。虽然依然瘦削，他已练就一身强壮体魄。同学们都说他幽默风趣、活力十足、信心坚定。跟在上海念书时期一样，他是个天生的领袖，能高瞻远瞩，看清目标，鼓励同侪努力达成目标。
中山大学少数已婚的夫妇档学生，起初被迫分开居住。男生住在中山大学校内，女生则安置在彼得洛夫卡街一个旧俄贵族的宅第。在学生的抱怨之下，校方一边开始兴建夫妻宿舍，一边设立“幽会室”，供夫妻档学生燕好之用；未婚的革命情侣也偶尔利用幽会室谈情说爱。
