消化系统功能紊乱
消化系统中发生在食道的四个主要的生理活动是：
摄取——消化——吸收——排泄
食道是从口开始；经过胸部、腹部及骨盆部位，直到肛门结束（如图2所示）。所以，当你进食的时候，身体内的一系列消化活动就开始发生了。由此可分为咬动（咀嚼）食物的机械消化及通过生物酶对食物发生作用的化学消化。这些生物酶存在于体内不同的消化腺体的分泌产物中。
生物酶是由蛋白质构成的极小的化学物质，它可以提高化学反应速率而本身结构不发生永久性改变。人体嘴里唾液腺分泌的唾液、胃部分泌的胃液、小肠分泌的小肠液、胰腺分泌的胰液、肝胆分泌的胆汁中均含有消化酶。
吸收是食物分解后的微小营养物质通过肠壁上皮细胞进入血液及淋巴的过程，在这过程里，可帮助这些营养分配到机体的细胞中。
最后，排泄是以粪便的形式将食物中不能消化、吸收的物质排出体外，如植物纤维中的纤维素。排泄物中也包含了胆汁及其分解（分解代谢）红细胞的产物。肠道排泄物几乎三分之一是由肠道细菌组成的。只有肠道每天清除掉这些代谢废物，才能保持机体功能稳定有效地运转。
最佳的健康状态源于消化系统的主要生理活动保持动态平衡并与身体其他部分的良好配合。反言之，一个以上的这些生理功能受到破坏，消化系统及机体其他部分将会出现不正常的表现。肝结石及胆囊结石的存在对食物的消化吸收及机体的排泄系统均会产生极具破坏性的影响。
口腔疾病
肝结石及胆囊结石也会导致口腔疾病。结石妨碍食物的消化及吸收，依次地迫使本应排出体外的代谢废物滞留在肠道里。堆积的废物会在肠道里营造毒性的、厌氧的环境，支持破坏性病菌繁殖、寄生及侵蚀健康的可复原的组织。
只有在肠道里积累了相当多的非被消化的物质时，口腔内才会发生细菌感染（譬如鹅口疮）及病毒感染（譬如唇疱疹）。破坏性细菌尝试分解其中一些废物，但同时会产生极强的毒性，其中一些可能被血液及淋巴液吸收，被运输到肝脏。剩余的那些毒物将继续潴留在肠道里，持续地刺激着消化道上皮组织（从口腔开始到肛门结束）。最后的结果是，肠壁将发生炎症甚至发展成溃疡。坏死的肠道组织会开始“邀请”越来越多的微生物来到这个受损的环境，协助破坏及分解所有衰弱及已被破坏的细胞。我们称之为“感染”。
感染似乎是普遍存在于有物质需要被分解的自然环境中的一种正常现象。细菌永远不会去主动攻击，也就是感染某样事物，它们像挂在树上的营养充足的果实一般，是干净的、有生命力的、健康的。只有当果实过分成熟后缺乏营养供应或掉到了地上时，细菌才开始它们的清理工作。在分解食物或机体组织时，细菌会产生毒性物质。你可以从令人不快的气味及其导致酸性环境的现象来分辨出这些毒物。在细菌对未被正确分解的食物起作用时也会出现同样的情况。这些情况日积月累地不断发生，其产生的毒物足以导致人体出现疾病的症状。
鹅口疮的发病表示大量细菌的存在并广泛传播于胃肠道，包括口腔的范围。口腔里受到病菌侵蚀是因为其黏膜不如胃肠道下段上皮组织的功能成熟，更不如其具有抵抗力。鹅口疮主要是源于肠道里出现的障碍。那是因为机体免疫系统的大部分都位于胃肠道黏膜上，所以鹅口疮表示机体免疫系统功能总体变弱而导致疾病的发生。
