代理商当然也在与百度的合作中获得了极大的利益。
有代理商形容，拿到百度总代的资格，就像是中了千万大奖。
比如，2003年的深圳移动时代公司，当时在深房大厦一个小办公室里，全公司只有七八个人。而到了2005年年初，深圳移动时代公司已经有了一个四五百人的团队，其发展速度简直可以说是神速。
当然，如果赚钱太容易的生意，恐怕不会太长久。
特别是：当你没有什么核心竞争力的时候！
代理商，仅仅只是靠百度的招牌，就可以百万千万地赚钱。
在百度的起步阶段，这可以理解为共赢。
但是，如果百度的实力增强到可以独立开展业务呢？
于是，百度与代理商的关系，慢慢变得不那么融洽。
当百度的品牌越做越大时，李彦宏又做了重要的决策，在北京、上海、广东等大客户集中的地区设立百度自己的营销中心。
百度是一个公司，也是一个商业组织。
而百度的代理商也是一个独立的公司。
商业组织与商业组织之间，本来就是利益的关系。
后来，百度与代理商之间发生了冲突。
于是，“巨网风波”出现了。
2004年7月，一篇名为《上帝公平的是：给了我们每个人的都是只有一条命》的文章出现在一家搜索引擎代理商的公司网站上，这篇措词激烈的文章出自广州巨搜网网络技术有限公司（简称：巨网）负责人戴森之手。
戴森表示，百度在无任何先兆的情况下，公布了广州、上海、北京三地首批地区核心代理的通知，巨网竟然没有名额。
同时百度还关闭了巨网客户终端新客户开户的权利，而巨网与百度签订的合约要至2004年12月31日才到期。
百度网站公告对此的解释是由于存在多次违规，巨网被取消了代理权限：（巨网）由于采取多收费，少转账的做法随意截留客户预付金，一次收取的开户费用超过百度标准价格数倍，其行为已经严重损害客户、百度和其他合作伙伴的利益。
双方都有道理。
后来，这件事情平息了，据说是百度给予了巨网一定数量的补偿，但双方也从此彻底说“拜拜”了。
