1873年，勒?普朗根和他第二任妻子、22岁的爱丽丝?迪克森（Alice Dixon）到了尤卡坦。他总喜欢把他的妻子称为该领域内的合作者，他们在尤卡坦花了12年研究玛雅遗迹。他们一起住在奇琴伊察附近，拍摄了五百多张照片，绘制了很多图画，勘测了建筑和遗址，挖掘出了一尊巨大的半躺半卧查克.穆尔（Chac Mool）神像，这是尤卡坦玛雅神像。神像肚子上有一个石碗，举行仪式时，尤卡坦人就在这个石碗中点燃新的火种。19世纪60年代，当地爆发了名为“阶级战争”（Caste War）的起义，那次起义中残存的革命情绪依然一触即发。墨西哥城的偏远地带远离统治中心，非常危险。
勒?普朗根在尤卡坦的时候掌握了玛雅语，并结交了当地一些牧师，其中包括一名他认为年龄高达150岁的智者。另外，他在庙宇里的生活荒诞而神秘，有时候他在遗址工作时感觉到时空错置，或者被一道耀眼的光芒笼罩在神秘的光辉里。他感到玛雅里面存在着“玄妙智慧和实践的含义丰富的生活之流，这股生活之流的源头来自极其古老的过去，远在普通历史研究的范围之外”。我们可以想象玛雅考古学家约翰.埃里克.西德尼.汤普森（J. Eric S. Thompson）考虑着同样的问题，对他非常崇敬的玛雅朋友（他的精神上的“名义父亲”）哈辛托.卡内尔（Jacinto Cunil）有着同样的感觉。
但是勒.普朗根丝毫不被大学中的规则所禁锢，他发表了汤普森不敢见之于书面的东西。他猜测哥伦布发现美洲大陆之前的玛雅流行催眠术，还使用魔镜来预见未来，他们显示出敏锐的洞察力。他们确实有种“魔镜”——反照出菜肴和铜盘的黑曜石（dark obsidian）——还有玄乎的水晶石，其中一块落入伊丽莎白时代占星家约翰?迪（John Dee）手中。据迪自己坦率地披露，他通过这块来自西方大洋彼岸的神奇物件与天使们交流。
勒.普朗根最大的成就——从离奇琴伊察地表22英尺的地下挖掘出巨大的查克?穆尔神像——始终是中美洲考古学上真正奇异的一件大事。不得不说，以现代标准来衡量，勒.普朗根的方法奇怪而原始，但是在1876年，他是最早在墨西哥进行挖掘的考古学家之一。不可否认，他的方法并不正统。在奇琴伊察的一座建筑上，勒?普朗根声称他已经破译了关于查.穆尔神像的雕文，因此可以指出在哪里可以挖掘到这尊神像。显然，挖掘地址的确定更多地是随意选择而非根据象形地图。
