不同于传统育种技术，转基因技术对物种的改造过程可以说是“瞬间”即可搞定，无须引入时间纬度。对于工业文明来说，正如牛顿经典力学，时间是一个无须考虑的因素。但对于农业文明来说，时间却是一种重要的参量，犹如历史不能回避时间那样。这是因为，农业的对象，亦即每一个物种，都是漫长时间过程的产物，各个物种彼此之间相生相克的关系都是历经时间的考验磨合而成。有时一个外来物种往往会打乱本地生态系统的平衡，原因就在于它“瞬间”空降，来不及与本地物种建立某种联系。如此来看，转基因作物将会对生态系统的平衡带来何种潜在影响，同样难以估量。（陈蓉霞：《转基因大跃进令人胆战心惊》，载《东方早报》，20100210。）
——陈蓉霞，上海师范大学哲学学院教授
杂交最远发生在属间，科间就需要人帮助了，如马和驴的杂交。而转基因可以发生在不同的类群（生物类群中的界有三大类，动物界、植物界、微生物界，界以下分别是门、纲、目、科、属、种）之间，如将深海里鱼的基因转移到西红柿上，将微生物的基因转移到水稻里去。杂交在自然界中可以自然发生，而不同界的生物之间的杂交是零概率事件。（蒋高明：《转基因不是杂交，两者不能混淆》，见蒋高明的博客。）
——蒋高明，中国科学院植物研究所研究员
针对反对者的怀疑，2010年3月初，中国工程院和中国科学院十位院士表示，要大力推进生物技术研究与应用。其中，中科院院士、中科院北京基因组研究所所长杨焕明说：
尽管现在有各种各样的批评，我仍然毫不犹豫地支持转基因植物和动物。转基因本身没有毒，它们同别的基因有什么相互作用也被研究得一清二楚。（《十位院士谈转基因：大力推进生物技术研究与应用》，20100304，见人民网。）
人类对基因、对生命的了解真的已经如此透彻了吗？的确，我们已经实施了“人类基因组计划”，耗费巨资进行了基因组DNA全序测定，把A\G\C\T四种核苷酸的排列次序挨个弄清楚了。我们已经知道，仅仅这比7音阶还简单的4个字母，就奏响了无限神奇的生命乐章以及精彩绝伦的生命故事。但为什么科学家仍然无法解释，为什么人与鼠不到300个基因的差别使得人之所以为人，鼠之所以为鼠？为什么无法解释人与黑猩猩基因结构1 2%的差异却使得人类超越了非洲丛林中的“亲戚”，成为了万物之灵？为什么无法解释人与人之间99.99%的基因相同，而0.01%的差别却使得有的人勇敢智慧，有的人邪恶贪婪？
