人类文明中有许多未解之谜，比如埃及的金字塔、玛雅人的编年历；神话的同一性、早期文献的相似点……等等。这些未解之谜都有一个基本的倾向，那就是它们出现的时间比专家们估计的要早，而它们表现出来的文明程度，又都远远超越了现代科学的研究结论。
而在这诸多的未解之谜中，最现实的谜案就是中国的中医，它就好像是一具活的化石，在我们眼前晃来晃去。几千年过去了，我们触摸它、研究它，忍受着它无言的嘲弄，可就是不知其所以然。直到今天，《黄帝内经》与《易经》、《山海经》号称“三玄”，依然像天书一样不可通解。
第一节 那些古代医书都去哪了？
今本《黄帝内经》包括《素问》、《灵枢》两篇，各九九八十一卷，合一百六十二卷。两书侧重点各有不同，《素问》侧重于讲理论，如阴阳五行、病因、藏象、气血精液等，而《灵枢》则侧重于讲经络、针灸。
《黄帝内经》书名首见于《汉书?艺文志》，当时班固在写《汉书》时，将图书目录类统归于《艺文志》下。医药类书目又分为“医经”、“经方”、“房中”、“神仙”四小类，共记录医学文献868卷，其中“医经”类七家，共216卷，名目如下：
《黄帝内经》十八卷
《外经》三十七卷；
《扁鹊内经》九卷
《外经》十二卷；
《白氏内经》三十八卷
《外经》三十六卷；
《旁篇》二十五卷
从以上记载中可以看出，“内经”一名本不专指《黄帝内经》，但由于其它医书均已遗失，所以我们今天所说的《内经》就专指《黄帝内经》而言。
但《汉书》里没有说《黄帝内经》十八卷究竟包括哪些内容。到了晋朝，有一位大学者名皇甫谧在《甲乙经序》中说：“《黄帝内经》十八卷，今天有《针经》九卷，《素问》九卷，二九十八卷，即《内经》也。亦有所亡失。”文中的亡失是指《素问》的第七卷。现代人都认为，皇甫谧学术造诣很高，而且他生活的年代距汉代不远，故本其所言，将《内经》定为《素问》、《灵枢》两部分。
但也有学者不同意，认为《汉书》所载卷数18与今《内经》162篇对不上号，因为汉代没有积篇为卷的说法。据此，有人推论，当时《内经》的字数很少，大约只有今本的九分之一。其次，从内容分析，《素问》侧重理论，《灵枢》侧重经络针灸，两书用语、理论取舍均有不同之处，可证这是两部不相关的独立著作。
《汉书》其它子目下的著作也都与医学有关，“经方”包括方药、本草、内、外、妇、儿各科医书，总11家274卷；房中与神仙两类，也涉及医学内容，如房中类的“养阳方”、“有子方”，神仙类的按摩术、引导术等。
目前比较一致的看法是，《黄帝内经》与神话中的黄帝本无关联，冠以“黄帝”之名，是为了追本溯源。黄帝乃传说中的古帝王，曾有许多重大发明，使后人受益匪浅，故中华民族一直以黄帝为祖先，历代后人均以黄帝子孙为荣。古人由此将一切文物制度都归于黄帝名下，《淮南子?修务训》曾总结过这种归祖情结说：“世俗之人，多尊古而贱今，故为道者必托之于神农、黄帝而后能入说。”
《素问》之名，始见于张仲景《伤寒论序》：“感往昔之沧丧，伤横夭之莫救，乃勤求古训，博采众方，撰用《素问》、《九卷》、《八十一卷》、《阴阳大论》、《胎胪药录》，并《平脉辩证》，为《伤寒杂病论》合十六卷。”在我国正史中，《素问》之名见于《北齐书?马嗣明传》：“马嗣明，河内人，少明医术，博综经方，《甲乙》、《素问》、《明堂》、《本草》，莫不咸诵，为人诊候，一年前知其生死。”在目录学上，《素问》之名始见于《隋书?经籍志》：“黄帝素问九卷。”
