在占领小田原城后，北条早云又采取了一系列的军事行动去巩固他的领地。他一方面与名义上的主君今川氏亲联合，发起了攻击远江和三河的战争。另一方面也获得了今川氏亲的支持，使他能联合上杉定正的养子上杉朝良，进攻山内上杉家。在永正元年（1504）九月的立河原之战中，北条、今川和扇谷上杉成功击败了上杉显定。山内上杉家损失近2000人。北条早云的势力进入镰仓一带。
遭受重大损失的山内上杉家却很快卷土重来，而扇谷上杉则已经到了强弩之末。永正二年（1505）三月，上杉显定再次进攻武藏、相模等地，无力抵抗的上杉朝良被包围在河越城，被迫接受出家为僧的条件。祸害关东地区长达20余年的“长享之乱”至此以扇谷上杉的屈服而落下帷幕。
而在长享之乱中，占便宜最大的并不是争得你死我活的两上杉中的任何一家，从各方面来看，北条早云才是这场长享之乱中的最大赢家。他利用两上杉的矛盾，处理今川内乱，吞并伊豆，奇袭小田原城，由一个默默无闻的今川家臣一跃而成为一位大名。下一步，他就要把手伸向昔日的盟友扇谷上杉家，因为这个长享之乱的输家，如今的实力已经一落千丈。
四、征服相模
在长享之乱以后，北条早云首先的目标是武藏，而武藏是扇谷上杉家的地盘，进攻武藏就意味着北条早云要与扇谷上杉决裂，而决裂的契机则是永正四年（1507）开始的又一次关东大乱，主角则是越后的守护代长尾为景，此人的儿子就是日本战国赫赫有名的军神上杉谦信。
永正的骚乱是长享之乱的后遗症。越后守护上杉房能的家臣长尾为景是一个实力派人物，他已经完全控制了越后的政局。永正四年（1507），长尾为景私下里拥立了上杉房能的养子上杉定实，杀死了上杉房能。这一事件引起了山内上杉家的注意。上杉显定作为上杉房能的兄长，自然不能坐视不理，于是他就以此为借口，于两年后征伐越后，越后国的长尾家就与山内上杉家进入敌对状态。看到这个消息的北条早云自然不肯放过这一机会，敌人的敌人就是自己的朋友，老奸巨猾的北条早云立刻决定响应长尾为景。另一方面，古河公方足利政氏也在这个时候与他的儿子足利高基发生矛盾，山内上杉为整理古河公方的内部问题忙得焦头烂额，无暇分身，这使长尾为景和北条早云都有了积蓄力量的机会。
因此，长尾为景虽然在永正六年（1509）暂时失败，但他在第二年就恢复元气，在长森原击败了山内上杉家，上杉显定在战败以后被人刺杀，山内上杉家的势力遭受重大打击。上杉显定死后，他的继承人问题也随之浮现。本来上杉显定收有两名养子：上杉显实和上杉宪房，其中上杉显实原为古河公方足利政氏的弟弟，显定死后就被指定为继承人。这就导致了宪房的不满。同时古河公方的内乱也开始公开化，上杉宪房为争夺家督位，决定支持足利高基，而上杉显实明显就站在哥哥足利政氏一方。永正之乱开始扩大化。
值得一提的是，长享之乱后，扇谷上杉被迫屈服于山内上杉，讽刺的是，永正四年（1507）时，山内家上杉显定的养子上杉宪房甚至还娶了扇谷家上杉朝良的妹妹，一对冤家变成了亲家。上杉朝良也因此参与调停山内上杉的内乱，于是，这也使北条早云又有了和扇谷上杉反目的借口。
于是，在永正七年（1510）四月，北条早云趁山内上杉忙于应付长尾为景的机会，出兵武藏，正式与扇谷上杉开战。北条军很快就突破了武藏的防线，同时，北条早云事先做好了情报工作，他结连武藏权现山城的城主上田政盛为内应。北条军在政盛的帮助下很快渡过了多摩川直插武藏国内，引起了扇谷上杉的恐慌。
但是百足之虫，死而不僵。扇谷上杉虽然在长享之乱中元气大伤，却还有自保的能力。上杉朝良立刻出兵，把主攻目标定为叛乱的权现山城。他的妹夫上杉宪房也出兵支持。两上杉一合璧，北条早云的武藏攻势就落了空。七月，权现山城被两上杉联军攻克，上田政盛逃走。而在北条早云的后侧，相模的三浦氏作为扇谷上杉的家臣也展开了配合主君的攻势，他们攻克了住吉城。在两方面的压力下，北条早云被迫放弃了武藏国攻势，正式与扇谷上杉讲和。
